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在大自然界，能够引起物种改变的有两大因素：天然因素和人为因素。
一改变物种的天然因素
在自然界，所有生物都遵循“适者生存”的原则。由于天灾，如极冷、干旱、酷热等；流行性疾病，如瘟疫、霍乱、鼠疫、天花、痨病等；放射线，如宇宙恒星向地球靠近、放射性元素（含铀矿石）的辐射等；动物和植物的毒素，引起急性和慢性中毒；化学试剂，如杀死导致疾病的细菌的药物等等，这些自然条件对每种生物都要进行考验和筛选。为什么，同一物种，在相同的天灾下，有一些可以熬过，活了下来；而另一些，甚至绝大部分都死去呢？过去的迷信解析是“命不该绝”实际上是：各生物个体的染色体上的基因活性存在差别，从而出现不同的适应天灾的能力。后来发现，每个人细胞内的近三万个基因中，总有几个产生了变异。这种变异基因在特殊环境中，救了该生物的命。如果天灾的破坏力，连这些特殊基因也不适应的话，那么该物种只有遭绝灭的噩运。如6500万年前的恐龙，200万年前的长毛象等。
在物种存亡的关键时刻，也是物种突变，出现新物种的时刻。不太严重的天灾，对物种起选优去劣的作用；严重的自然灾害则是对整个物种进行考验，促使物种的大改观。
总的说来，单细胞生物（如细菌、病毒等）比多细胞生物（如人类、各种常见的动植物等）容易改变遗传基因，以适应外界条件的变化。在生命垂危时，通过染色体上基因的零时组合或者搭配，形成新的基因（从而生成新的蛋白质），以抵抗天灾。这也是细菌容易产生抗药性，出现新的变种的原因。人类等多细胞生物则失去这种灵活性，很难通过零时的基因组合来抵抗天灾。即使组成了新的蛋白质，出现异形基因；但是因为未改变生殖细胞内的基因，而不具备遗传的效果。这就是多细胞生物很难形成亚种的原因。
二改善物种的人为因素
有人认为，动物的进化，是由雌性决定的。因为在动物发情期，大部分由雌性选择交配对象，因而导致雄性越来越漂亮。这种看法过于夸大了雌性选美的作用。雌性的审美观的确对物种外观的改良起着重要的作用。这也是人类在灵长类动物中，从外貌到体型都是最佳的主要原因。但这种选择，必须有个基础，即有美可选。例如，单在黑猩猩或者猕猴中，雌性无论怎么挑选，也只能是踏鼻梁（对黑猩猩）或尖嘴猴腮（对猕猴）。在文章五谈“人类不是劳动创造的”——人类在何时形成中指出，因为在第四纪冰川期的第一个小冰川期的几十万年中，多种灵长类动物共同居住在低温溶洞区，改变饮食习惯和进行杂交，所产生的人类祖先——熟食人（即直立人）就是一个特大的混血种群体。在外貌和体型上，保留了各种灵长类动物的局部特征，其染色体上具有各种灵长类动物的基因，给人类外貌和体型的完美化奠定了基础。
应该指出：女性的这种选择不仅是美化了人类，而且还促使智人的产生。详情请看文章八谈“人类不是劳动创造的”——熟食人。
各种动物之间的吞食，也是一种改善物种的非自然因素，现在将它统称作“人为因素”大型动物猎杀其他动物，尽管非常血腥，但对被食动物的去莠，提高整体素质起了积极作用。
此外，许多动物争夺交配权，也是一种改良物种的人为淘汰措施。海狮、角鹿等动物在繁殖季节，雄性为取得交配权，获得交媾快感和虚荣心，进行着残酷的争夺战。获胜者可以成为一群雌性的拥有者，新的雄性只有打败了占有者，才能取而代之，成为雌性群体的霸主。这实际上是一种基因行为，让最强壮的雄性留下遗传基因，以保证整个种族的健康延续。
可惜的是，我们人类在近五六千年来推行父权制，出现一批特权阶层。他们倚仗手中的权力和父母的庇护，强行遗传不良基因。许多体质差、矮小瘦弱、智力低、外表丑陋的人，以及暴躁、凶残、奸诈、阴险、虚伪和贪得无厌的人拥有更多的交配机会。这是人类虽然经历五六千年的漫长演化，但在素质上一直未能明显提高的主要原因。即在特权的下面，上述的各种人为因素对人类的物种改良，作用不大。