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原来是中华联盟本身出了大事，准确的说是清国出了大事。清国的东北爆发了严重的鼠疫，短短20天内竟然有三千多人死亡，平均每天都有170多人因为鼠疫去世，而清国将大量的医生动员去了欧洲，导致国内医护不足，尽管光绪紧急从川滇陕等地调集医务人员支援，也实在有些捉襟见肘的感觉，于是光绪不得不召回这些赴欧的收容所的医生们。
此时作为吉林将军的袁世凯在鼠疫爆发的最初便下令封闭城市，所辖各城许进不许出。清朝时期东北地区施行有别于关内“行省制”的“军府制”，吉林将军为东北地区三个将军之一，统辖今天的吉林省中东部分，是行政军事一把抓的最高长官。此时人们终于知道了微生物的存在，袁世凯也明白这场瘟疫跟老鼠的关系，于是除了向朝廷汇报求助以外，官府下令悬赏灭鼠，1元钱一只老鼠。袁世凯的灭鼠行动非常成功，官府收集销毁10万只老鼠尸体。可是尽管杀死了那么多的老鼠，可是疫情却是丝毫不见缓解。
袁世凯的发迹史便是与日本人的争斗史，使得袁世凯袁将军对于日本人的态度有些习惯性的偏见，不过好在袁大人可能不算是智者，但一定是一个聪明人，因为他从来都不会排斥有用的人。比如站在他面前的这位胖乎乎的老者，这位老者名叫北里柴三郎。北里是一个医生，是一个日本医生，此时的他身上散发出一股子奇怪的味道，袁世凯却好像没有闻到一样。亲热的握着他的手。这位日本来的北里大夫是日本著名的细菌学专家，此次他带领他的团队来到清国，通过解剖了一万只老鼠得到一个事实。此次的鼠疫和历史上的鼠疫都不相同，病原体并不来自于城市里可见的老鼠，其传染方式似乎也不一样。而他就是特此来向袁世凯阐述他的解剖成果。
“北里大夫，那请问我们应该如何应对这次鼠疫呢？”袁世凯显得和北里非常亲近。“将军您的做法我是非常认同的，封城的确能有效的抑制鼠疫蔓延。纵观历次鼠疫，您应该是做的最好的。” 袁世凯并不在意北里柴三郎的夸赞，有点恼火道“大夫，我们不可能一直这样封锁下去，你知道这样下去，一定会产生恐慌的！”北里摇了摇头，脸上的肥肉因为摇晃而抖动“在我们没有找到病原体和传染方式之前，我们的确只能坐等待变。”北里看着袁世凯脸上失望的神色犹豫片刻继续道“我的医疗团队在解剖研究的时候发现，官府给我们提供的解剖样本之中很多都比较干净。”北里知道袁世凯的疑惑，解释说道“您知道，老鼠他们穿梭在城市里的任何角落。比如城市的垃圾站，以及下水道之类的地方。所以它们身上都会带有非常多的。”说道这里北里不知道该怎么给他的听众解释什么叫微生物，或者说他也实在懒得和这位生物盲的将军解释于是他选择换了一个词“它们身上会携带大量的病源。”袁世凯点点头表示理解，北里继续说道“而官府为我们提供的大多解剖样本相比之下过于干净了，这并不符合老鼠的习性。所以我们怀疑，官府所提供的解剖样本大都应该是来自于人工养殖，而不是通过城市里捕捉得到。”北里沉默片刻微微整理措辞道“我个人认为，这次鼠疫的病原体虽然并不携带在城市老鼠身上，但是这样大规模的养殖，我认为还是非常危险的，所以请将军务必严格禁止！”袁世凯是什么人，当即便已将事情猜的七七八八，不过脸上却是不动声色，向左右随侍的亲卫招手令其调查此事。出了这么一档子事儿，袁世凯虽然脸上什么都没显露出来，但是心里却是恼火的很。不过对于北里柴三郎袁世凯还是比较尊敬的，要知道自从这位北里大夫从日本来到东北可是一天都没有休息，没日没夜的开展着他们的解剖工作，甚至他们牺牲掉了大部分的吃饭、睡觉的时间。这些袁世凯可都看在眼里，尽管北里大夫仅仅只是确认了这次瘟疫并不来自于常见的老鼠，并没有能对这次瘟疫提出什么有效可靠的意见。袁世凯可不是那种不识好歹的人，在居住上袁世凯给予了北里大夫最好的待遇，还委派的30个下人为其驱使，更不要说士兵的严密保护了。袁世凯更是亲热的挽着北里大夫的手亲自将其送到了专门为他准备休息的堂倌。